工资和社保由不同公司发放缴纳不合法。依据《社会保险法》，社保应由用人单位缴纳，与工资发放单位应一致。不一致可能导致劳动者权益受损，如社保断缴影响待遇享受。
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处理此问题常见方式为与用人单位协商或向劳动监察部门投诉。若单位违法，可先尝试协商纠正；协商无果则向劳动监察部门投诉，以维护自身权益。
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不合法。处理方式：1.与用人单位沟通，要求统一工资和社保缴纳单位；2.若沟通无果，收集证据，如工资条、社保缴纳记录；3.向当地劳动监察部门投诉，提交证据；4.必要时，可寻求法律援助或提起诉讼。