公司扣工资做法不当。依据《劳动法》，解除劳动合同时应一次付清工资。扣工资可能影响员工权益，造成不良后果。
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常见处理方式为协商或申请劳动仲裁。若扣工资数额不大，可先与公司协商；若协商无果或数额较大，建议申请劳动仲裁以维护权益。
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公司扣工资不对。处理方式：1.与公司协商，要求支付应得工资；2.若协商不成，收集证据，如工资条、聊天记录等；3.向劳动仲裁委员会申请仲裁，要求支付工资及可能的经济补偿；4.如仲裁结果不满，可进一步提起诉讼。