如果用人单位在扣工资时没有明确的规章制度支持，这种行为可能构成违法。根据《劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。你提到的调休后扣全勤奖的情况，若公司未事先在规章制度中明确此类情况的处理方式，则扣工资行为可能违法。你应先与公司沟通，要求解释扣工资的依据，若无合理解释，可按照解答内容中的方法，到劳动行政部门举报或申请仲裁，必要时可向法院起诉，要求支付被扣工资及经济补偿金。
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从法律角度看，用人单位在以下情况下可以合法扣减员工工资：1.员工因个人原因造成公司经济损失，公司可按约定从工资中扣除赔偿金；2.公司规章制度中明确规定的罚款或扣工资情形，且该规章制度不违反法律法规；3.代扣代缴个人所得税、社会保险费等法定扣除项目；4.法律法规允许的其他扣减情形。除上述情况外，用人单位不得随意扣减员工工资。
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除了投诉，你还可以通过以下方式维护自己的合法权益：1.与用人单位协商，明确表达你的诉求，即要求支付被扣的全勤奖，并指出公司规章制度中未明确此类扣工资的情况；2.若协商无果，可寻求工会帮助，工会通常会为员工提供法律援助或调解服务；3.准备充分的证据，如工资条、调休记录等，以备在投诉或仲裁过程中使用。